More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3553 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  76.17 
 
 		 597 aa  976    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  80.74 
 
 		 600 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  76.28 
 
 		 613 aa  975    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 598 aa  1234    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 596 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  79.03 
 
 		 604 aa  994    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 		 600 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 593 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 593 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 		 598 aa  1231    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 600 aa  934    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  79.7 
 
 		 601 aa  1006    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 599 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 600 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 600 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 600 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 570 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 570 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 567 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 570 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 585 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 573 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 574 aa  519  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 570 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 569 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 578 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 569 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  45.27 
 
 		 575 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 578 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 578 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 573 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 573 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 566 aa  508  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 572 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 572 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 572 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 576 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 578 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 572 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 572 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 572 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 572 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 578 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 572 aa  505  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 574 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 576 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 571 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 571 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 579 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>