More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1767 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 573 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 570 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 573 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 571 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 585 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 570 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1189    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 576 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 570 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 576 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 574 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 570 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 568 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 571 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 570 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  55.71 
 
 		 575 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 571 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 577 aa  615  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 574 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 573 aa  614  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 580 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 578 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 580 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 574 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 578 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 578 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 578 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 569 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 578 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 578 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 578 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 578 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 568 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 571 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 579 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 578 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 575 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 578 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 573 aa  601  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 578 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 580 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 569 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 582 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 574 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 573 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 584 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 568 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 573 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 569 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 583 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 584 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 574 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 570 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 571 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 572 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 579 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 571 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 572 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 572 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 570 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 570 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 575 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 570 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 571 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 572 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 574 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 576 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 572 aa  588  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 571 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 571 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 571 aa  586  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 574 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 568 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 572 aa  581  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 567 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>