More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1354 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  87.72 
 
 		 570 aa  1045    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 573 aa  644    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 570 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 578 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 578 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 578 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 580 aa  703    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 572 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 584 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 573 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 579 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 572 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  68.54 
 
 		 571 aa  808    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 578 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 574 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1170    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 		 574 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  70.04 
 
 		 576 aa  827    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 573 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 578 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 579 aa  687    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 		 585 aa  961    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 568 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 570 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 578 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 575 aa  741    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 578 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 578 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 570 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 570 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 578 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 570 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 572 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 578 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 578 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 569 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 578 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  76.75 
 
 		 573 aa  925    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  76.4 
 
 		 573 aa  920    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  70.78 
 
 		 576 aa  840    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 570 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 574 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 574 aa  633  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 566 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 569 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 580 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 580 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 568 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 582 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 573 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 571 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 574 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 576 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 573 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 568 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 572 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 572 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 571 aa  618  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 571 aa  617  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 571 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 572 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 572 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 571 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 567 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 572 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 572 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 571 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  54.95 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 571 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>