More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0892 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 570 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 585 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 572 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 573 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 571 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 570 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 		 573 aa  723    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 570 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 575 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 572 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 569 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 		 574 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 573 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1178    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 566 aa  656    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 572 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 570 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 570 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 574 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 576 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 568 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 584 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 576 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 580 aa  599  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 575 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 567 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 577 aa  593  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 564 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 569 aa  590  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 577 aa  591  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 566 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 566 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 573 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 566 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 569 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 580 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 574 aa  581  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 566 aa  581  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 569 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 572 aa  580  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 569 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 580 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 564 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 568 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 576 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 574 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 571 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 571 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 566 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 571 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 574 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 568 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 571 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 571 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 570 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 573 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 574 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 573 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 571 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  49.19 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 577 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 572 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 572 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 572 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 571 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 572 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 572 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 572 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 571 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 574 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 572 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>