More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2425 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 570 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 572 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 585 aa  634    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 570 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 574 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 570 aa  713    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  99.47 
 
 		 570 aa  1163    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1167    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 569 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 572 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 580 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 566 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 573 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 566 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 573 aa  628  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 566 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 567 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 573 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 570 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 575 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 566 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 572 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 567 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 571 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 574 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 568 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 576 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 580 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  51.5 
 
 		 575 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 579 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 580 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 574 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 578 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 570 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 573 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 577 aa  570  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 570 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 578 aa  566  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 578 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 578 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 578 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 578 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 578 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 578 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 571 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 576 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 564 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 574 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 572 aa  560  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 577 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 572 aa  558  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 572 aa  555  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 600 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 571 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 569 aa  558  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2220  prolyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 572 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 574 aa  551  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 571 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 572 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 572 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 572 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 572 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 571 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 597 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>