More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2891 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 578 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  75.31 
 
 		 570 aa  923    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 570 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 578 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 584 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 575 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 570 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 574 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 570 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  99.3 
 
 		 573 aa  1165    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 579 aa  692    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 578 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 578 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 578 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 		 571 aa  820    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 578 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  76.75 
 
 		 570 aa  925    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 574 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 578 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 573 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 578 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 578 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 578 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 578 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 568 aa  642    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  67.13 
 
 		 576 aa  805    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 574 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 574 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 575 aa  746    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 573 aa  1172    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 580 aa  708    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 570 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 572 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 578 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  80.77 
 
 		 585 aa  977    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 578 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 578 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 578 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 576 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  69.76 
 
 		 576 aa  838    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  58.69 
 
 		 569 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 578 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 572 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 569 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 573 aa  625  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 580 aa  627  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 570 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 570 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 578 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 580 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 568 aa  617  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 577 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 571 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 574 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 570 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0846  prolyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 581 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.889779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 574 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0775  prolyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 581 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 573 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 571 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 574 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 572 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 567 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 582 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 571 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 571 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 576 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 571 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 577 aa  596  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 571 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 571 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 571 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 567 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 580 aa  598  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 571 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 571 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 581 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3670  prolyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 581 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.981514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 571 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 571 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 569 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0745  prolyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 581 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 573 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 572 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 568 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 571 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 572 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>