More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2947 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 585 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 570 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 570 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 573 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 566 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 572 aa  743    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 569 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 570 aa  713    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 570 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 570 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 		 574 aa  690    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 572 aa  1171    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 570 aa  776    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 		 572 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 573 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 573 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 566 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 566 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 566 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 566 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 566 aa  617  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 566 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 566 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 566 aa  618  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 566 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 566 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 566 aa  616  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 575 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 571 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 574 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 568 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 567 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 579 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 577 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 567 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 580 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 576 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 576 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 574 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 574 aa  582  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 584 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 574 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 569 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 578 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 564 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 573 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 564 aa  570  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 577 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 565 aa  557  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 570 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 572 aa  557  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 582 aa  557  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 571 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 570 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 570 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 578 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 574 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 578 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 566 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 564 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 578 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 571 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 578 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 576 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 573 aa  547  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 571 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 578 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 568 aa  541  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 571 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 577 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 571 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 578 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 578 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 578 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 571 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 578 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 578 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 571 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 578 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 574 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 578 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 578 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>