More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07770 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 
585 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
570 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
569 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 
573 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
570 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
574 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
568 aa  1155    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 
573 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
576 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
567 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
567 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
566 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
566 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
566 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
575 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
566 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
566 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
566 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
566 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
566 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
573 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
566 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
566 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
570 aa  622  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
580 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
574 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
571 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
579 aa  617  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
574 aa  618  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
571 aa  614  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
584 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
572 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
576 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
570 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
572 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
574 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
575 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
576 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
566 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
578 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
578 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
570 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
570 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
578 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
578 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
578 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
578 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
569 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
578 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
569 aa  588  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
567 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
578 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
572 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
569 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
578 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
569 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
580 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
569 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 
569 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
572 aa  579  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
578 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 
578 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
567 aa  579  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
567 aa  579  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
573 aa  576  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
574 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  51.49 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
578 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
573 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
583 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
574 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 
573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
572 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
572 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>