More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_312 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  96.31 
 
 		 569 aa  1138    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 569 aa  1176    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  93.15 
 
 		 569 aa  1111    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 585 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 573 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 573 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 573 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 568 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 570 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 570 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 570 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 576 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 576 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 569 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 571 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 572 aa  548  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 584 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 577 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 575 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 570 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 570 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 580 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 568 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1793  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 595 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 574 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 579 aa  524  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 578 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 566 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 578 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 565 aa  521  1e-146  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3563  prolyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 566 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 579 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 580 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 578 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 575 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 578 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 578 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 570 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 577 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 570 aa  505  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 573 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 570 aa  505  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 574 aa  502  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 573 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 582 aa  501  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 567 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 567 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  45.57 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3947  prolyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 575 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 574 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>