More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0686 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
565 aa  1158    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
564 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
570 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
585 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
577 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
572 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
574 aa  557  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
570 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
572 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
575 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
570 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
576 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
573 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
577 aa  548  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
566 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
566 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
567 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
566 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
579 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
574 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
566 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
566 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
574 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
576 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
570 aa  535  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
567 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
569 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
571 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
574 aa  525  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
575 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
569 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
584 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
569 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
580 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
568 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
564 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
565 aa  512  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
569 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
572 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
574 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
567 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
582 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
570 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
569 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
567 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
570 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
576 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
567 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
577 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
578 aa  499  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
573 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
579 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
578 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
582 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
570 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
573 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
578 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
568 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
571 aa  485  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
565 aa  485  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
583 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
574 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
578 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
578 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
572 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
578 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
574 aa  478  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
578 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
569 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
567 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  42.23 
 
 
570 aa  473  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
598 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
569 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
598 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
574 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
571 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
580 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>