More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1325 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 
569 aa  793    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 
569 aa  794    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  65.54 
 
 
569 aa  793    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  66.31 
 
 
569 aa  795    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
567 aa  1162    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  68.2 
 
 
567 aa  812    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 
565 aa  774    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  68.2 
 
 
566 aa  801    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 
567 aa  764    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
571 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 
564 aa  547  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
569 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
574 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 
570 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
570 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
576 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
576 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
570 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
579 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
572 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
585 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
574 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
571 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
577 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
570 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
573 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
567 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
576 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
573 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
566 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
577 aa  500  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
566 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
566 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
566 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
566 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
566 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  46 
 
 
574 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
572 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
567 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
573 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
570 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
575 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
584 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
570 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
566 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
578 aa  494  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
574 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
566 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
570 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
573 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
574 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
571 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
570 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
566 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
569 aa  485  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
567 aa  481  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
578 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
576 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
582 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
600 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0833  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
580 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508251  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  44.13 
 
 
570 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
574 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
572 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
565 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
597 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
573 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
604 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
578 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
572 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
568 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
575 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2392  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
581 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0775  prolyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
581 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
578 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0846  prolyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
581 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.889779  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 
577 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
580 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
573 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
567 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
564 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>