More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1959 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  75.12 
 
 		 613 aa  948    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 596 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  75.17 
 
 		 598 aa  936    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  73 
 
 		 604 aa  930    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 593 aa  671    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 593 aa  717    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  73.67 
 
 		 600 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 600 aa  1226    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 597 aa  904    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  71.5 
 
 		 601 aa  911    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 598 aa  934    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 599 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 600 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 596 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 600 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 600 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 600 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 600 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 569 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 571 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 573 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 570 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 570 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 570 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 570 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 573 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 571 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 578 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 570 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 578 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 570 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 571 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 572 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 585 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 578 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 571 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 576 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 570 aa  525  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 571 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 571 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 578 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 576 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 575 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 571 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 576 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 569 aa  518  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 571 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 569 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 569 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 566 aa  515  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 574 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 580 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 574 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 584 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 574 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 566 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 566 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 573 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 574 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 573 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 574 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 566 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 572 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 572 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 572 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 572 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>