More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1841 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 598 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 596 aa  1230    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 600 aa  650    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 604 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 593 aa  753    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 		 593 aa  739    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 598 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 600 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 600 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 600 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 		 600 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 601 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 600 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  96.81 
 
 		 596 aa  1150    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 599 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 613 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 597 aa  628  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 571 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 585 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 574 aa  503  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 569 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 570 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 574 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 569 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 564 aa  478  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 569 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 584 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 566 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 573 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 570 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 576 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 576 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 567 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 566 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 569 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 575 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 569 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 574 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 572 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 574 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 571 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 571 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 572 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 573 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 571 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 571 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>