More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1529 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1236    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
599 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  80.74 
 
 
598 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  80.33 
 
 
604 aa  1028    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
593 aa  650    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
593 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  77.21 
 
 
613 aa  994    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  73.67 
 
 
600 aa  932    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
600 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  77.89 
 
 
597 aa  1002    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  76.17 
 
 
601 aa  983    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  80.9 
 
 
598 aa  1026    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
596 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
596 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
600 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
600 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
569 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
570 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
570 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 
571 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
567 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
600 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
573 aa  542  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
567 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  47 
 
 
570 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
570 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
578 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
578 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
572 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
576 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
572 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
570 aa  525  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
578 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
578 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
578 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
578 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
569 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
568 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
573 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
578 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
578 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
575 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
580 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
578 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
573 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
578 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
570 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
578 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
578 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
571 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
573 aa  519  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
571 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
578 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
576 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
578 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
574 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
569 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
573 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
574 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
571 aa  515  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
572 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
578 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
576 aa  515  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
585 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
574 aa  511  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
574 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
578 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
573 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
578 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
573 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
566 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
574 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
570 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
571 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
571 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
566 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
574 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
571 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
570 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
570 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
571 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
576 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  45.92 
 
 
575 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
571 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>