More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0509 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 593 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 593 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  79.67 
 
 		 600 aa  999    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 600 aa  1229    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  90.33 
 
 		 600 aa  1111    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  89.83 
 
 		 600 aa  1112    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 600 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 599 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 596 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 596 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 601 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 597 aa  570  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 613 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 604 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 600 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 571 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 585 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  41.39 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  445  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 573 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 572 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 572 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 568 aa  442  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 570 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 569 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 574 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 569 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 569 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 576 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 571 aa  435  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 575 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 569 aa  432  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 572 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 570 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 580 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 572 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>