More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0693 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 600 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 613 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 598 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 		 599 aa  865    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 		 596 aa  722    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 600 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 600 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 604 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  74.54 
 
 		 593 aa  924    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 593 aa  1219    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 600 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 600 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 598 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 600 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 597 aa  653    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 601 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 600 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 		 596 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 576 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 567 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 573 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 568 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 573 aa  492  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 585 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 571 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 574 aa  487  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 571 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 567 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 571 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 569 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 571 aa  482  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 572 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 571 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 571 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 576 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 570 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 578 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 578 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 569 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 584 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 574 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 570 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 578 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 577 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 575 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 566 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  46.64 
 
 		 575 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 572 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>