More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1665 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 598 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 600 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 596 aa  738    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 600 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 604 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 597 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 593 aa  1217    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  74.54 
 
 		 593 aa  924    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 600 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 600 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 600 aa  653    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 598 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 600 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 596 aa  717    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 601 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 613 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 600 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 599 aa  843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 570 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 572 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 574 aa  483  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 573 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 584 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 573 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 568 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 574 aa  465  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 571 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 571 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 575 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 571 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 571 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 570 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 567 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 566 aa  455  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 578 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 578 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 576 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 566 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 584 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 566 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 569 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 572 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  42.55 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>