More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05661 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 598 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 598 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1841  prolyl-tRNA synthetase  96.81 
 
 		 596 aa  1177    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05651  prolyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 600 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 604 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1665  prolyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 593 aa  751    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0693  prolyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 		 593 aa  738    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05721  prolyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 600 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0509  prolyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 600 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 600 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 600 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05091  prolyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 600 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1318  prolyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 601 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05351  prolyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 600 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 599 aa  767    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05661  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 596 aa  1229    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 613 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 597 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 571 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 585 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 574 aa  502  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 573 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 573 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 567 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 567 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 569 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 570 aa  482  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 570 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 569 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 574 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 568 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 570 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 570 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 576 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 579 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 564 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 570 aa  475  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 576 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 584 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 576 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 575 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 572 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 571 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 572 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 572 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 574 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 571 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 572 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 572 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 574 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 573 aa  445  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>