More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0121 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 573 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 570 aa  764    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 573 aa  744    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  69.63 
 
 		 579 aa  830    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 569 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 571 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  62.43 
 
 		 585 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 570 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  75.83 
 
 		 574 aa  904    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 580 aa  805    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 576 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  78.99 
 
 		 574 aa  923    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 575 aa  1176    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  68.59 
 
 		 574 aa  803    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 576 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 568 aa  631  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 572 aa  618  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 566 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 574 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 570 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 573 aa  605  9.999999999999999e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 570 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 573 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 576 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 584 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 578 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 578 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 570 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 578 aa  595  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 578 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 578 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 567 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 578 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 569 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 578 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 571 aa  581  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 578 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 578 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 578 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 578 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 570 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 566 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 571 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 570 aa  571  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 571 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 573 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 580 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 564 aa  568  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 571 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 571 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 582 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 566 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 571 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 572 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 573 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 568 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 580 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 572 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 579 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 577 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 572 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 569 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 577 aa  559  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 569 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 580 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>