More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1460 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 578 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1174    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 578 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 575 aa  764    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 570 aa  671    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  80.14 
 
 		 585 aa  967    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 575 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  75.13 
 
 		 573 aa  922    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 572 aa  651    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 578 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 		 579 aa  689    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 584 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 578 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 572 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 580 aa  701    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 570 aa  671    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  69.04 
 
 		 571 aa  815    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 578 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  87.72 
 
 		 570 aa  1045    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 574 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 569 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 573 aa  646    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 578 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  75.31 
 
 		 573 aa  923    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 578 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 578 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 572 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 570 aa  648    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 		 574 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 568 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 578 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 570 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 570 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 578 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 570 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 569 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 578 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 576 aa  825    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 578 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 578 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  70.63 
 
 		 576 aa  842    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 574 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 578 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  61.75 
 
 		 574 aa  723    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 568 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 576 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 579 aa  630  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 573 aa  630  1e-179  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 566 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 573 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 571 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 568 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 582 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 573 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 577 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 571 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 574 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 572 aa  609  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 571 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 571 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 571 aa  608  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 570 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 570 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 570 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 574 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 		 576 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 580 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 571 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 580 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 571 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 574 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  53.74 
 
 		 575 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  54.51 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 572 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 567 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>