More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1909 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 570 aa  828    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 574 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1195    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 574 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 578 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 578 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 580 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 571 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 573 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 574 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 579 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  66.84 
 
 		 573 aa  807    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 578 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  63.59 
 
 		 571 aa  767    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 580 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  70.04 
 
 		 570 aa  829    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 574 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 578 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 578 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 580 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 570 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 573 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 578 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 574 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 575 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  67.36 
 
 		 573 aa  811    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 575 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 578 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  71.13 
 
 		 585 aa  840    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 584 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 578 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 578 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 576 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  74.69 
 
 		 576 aa  900    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 569 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 570 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 571 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 573 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 571 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 582 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 571 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 571 aa  628  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 574 aa  628  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 568 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 577 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 		 581 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 571 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 581 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 571 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 579 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 571 aa  621  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 583 aa  616  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 572 aa  615  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 567 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 570 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 571 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2392  prolyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 581 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 570 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 570 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 574 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 571 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 572 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 576 aa  614  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 572 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4212  prolyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 581 aa  611  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0833  prolyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 580 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 572 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 572 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>