More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2132 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 570 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 571 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 568 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 574 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1165    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 580 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 571 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 569 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 569 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 571 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 573 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 566 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 574 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 571 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 570 aa  664    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 571 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 570 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 568 aa  656    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 564 aa  638    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 569 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 571 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 576 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 573 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 571 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 573 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 571 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 573 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 568 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 571 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 573 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 585 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 576 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 576 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 572 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1165    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 571 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 572 aa  631  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 579 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 571 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 578 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 572 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 572 aa  631  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 571 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 571 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 572 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 578 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 577 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 571 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 571 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 571 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 578 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 570 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 571 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 578 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 578 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 570 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  56.06 
 
 		 572 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 583 aa  621  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 570 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 570 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 571 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 578 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 584 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 576 aa  618  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  55.79 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 578 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 574 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 573 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 576 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>