More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0769 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  78.05 
 
 		 569 aa  927    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  78.05 
 
 		 569 aa  926    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 565 aa  1155    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 		 567 aa  814    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 567 aa  774    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 569 aa  759    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 		 566 aa  766    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 567 aa  782    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  78.41 
 
 		 569 aa  926    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 564 aa  524  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 572 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 572 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 572 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 572 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 572 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 569 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 570 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 570 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 576 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 580 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 568 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 574 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 573 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 571 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 567 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 576 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 584 aa  485  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 571 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 571 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 585 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 577 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 574 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 574 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 576 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 575 aa  475  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 584 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 573 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 577 aa  472  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 571 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 572 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 576 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 571 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 571 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 571 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 568 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 572 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>