More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0568 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
569 aa  816    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1157    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  98.59 
 
 
569 aa  1147    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  78.05 
 
 
565 aa  927    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  98.07 
 
 
569 aa  1140    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  67.2 
 
 
566 aa  787    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 
567 aa  852    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 
567 aa  810    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  65.54 
 
 
567 aa  793    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
571 aa  541  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
564 aa  531  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
578 aa  511  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
569 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
580 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
573 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
576 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
570 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
572 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  45.69 
 
 
572 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
585 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
572 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
570 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
572 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
576 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
572 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
568 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
573 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
572 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
572 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
571 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
579 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
570 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
574 aa  492  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
574 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
571 aa  494  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
577 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
572 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
572 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
572 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
572 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
578 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
571 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
572 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
570 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
572 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
575 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
572 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
576 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
572 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
574 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
577 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
570 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
574 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
569 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
578 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
573 aa  488  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
571 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
584 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
576 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
584 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45 
 
 
570 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
577 aa  482  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  44.13 
 
 
570 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
571 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
567 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
572 aa  485  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
569 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
575 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  46 
 
 
574 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
569 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
571 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
571 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
572 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
570 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
570 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
571 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
570 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
571 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
578 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
578 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>