More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0063 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  70.89 
 
 		 574 aa  844    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 564 aa  1151    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  67.4 
 
 		 577 aa  780    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 582 aa  661    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 577 aa  771    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 574 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 569 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 571 aa  578  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 578 aa  578  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 573 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 566 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 572 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 572 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 585 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 564 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 566 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 575 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 570 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 566 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 566 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 566 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 576 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 566 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 567 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 566 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 567 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 570 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 567 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 574 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 570 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 580 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  48.76 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 570 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 575 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 573 aa  524  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 570 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10860  prolyl-tRNA synthetase, family II  50.09 
 
 		 588 aa  523  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 572 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 565 aa  521  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 568 aa  519  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 574 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 574 aa  515  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 565 aa  513  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 568 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 579 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 576 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 574 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 578 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 584 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 569 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 578 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 578 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 569 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 578 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 582 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 573 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 574 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 571 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 574 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 571 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>