More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1050 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 566 aa  1150    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 569 aa  801    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 569 aa  805    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 		 565 aa  780    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  67.72 
 
 		 569 aa  801    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  68.2 
 
 		 567 aa  815    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  80.04 
 
 		 567 aa  955    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 		 569 aa  809    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 567 aa  799    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 564 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 570 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 568 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 576 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 567 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 567 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 574 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 576 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 585 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 580 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 571 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 574 aa  489  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 573 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 584 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 577 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 579 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 574 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 575 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 572 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 566 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 574 aa  482  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 573 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 582 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 571 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 570 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 572 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 578 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 578 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 578 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 578 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 574 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 574 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  43.13 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>