More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0897 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 
569 aa  818    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
569 aa  816    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 
565 aa  759    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 
567 aa  833    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
566 aa  800    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
569 aa  813    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 
567 aa  793    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 
567 aa  767    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
569 aa  1160    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
571 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
564 aa  538  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
576 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
570 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
569 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
570 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
576 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
567 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
572 aa  497  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
571 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
576 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
573 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
570 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
567 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
571 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
573 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
585 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
576 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
580 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
584 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
574 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
571 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
573 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
570 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
573 aa  485  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
580 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
578 aa  479  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
574 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
574 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
572 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
574 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
574 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
574 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
578 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
570 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
580 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
565 aa  478  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
571 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
573 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
571 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
572 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
574 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
572 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
571 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
571 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
571 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
574 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
569 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
573 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
571 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
575 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
568 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
570 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
572 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
571 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
565 aa  472  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
580 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
572 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
600 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
572 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0833  prolyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
580 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508251  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
577 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>