More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 		 578 aa  735    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  100 
 
 		 570 aa  1170    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10860  prolyl-tRNA synthetase, family II  60.11 
 
 		 588 aa  683    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 565 aa  604  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 575 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 569 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 576 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 570 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 577 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 568 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 585 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 576 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 571 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 577 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 576 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 573 aa  537  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 579 aa  532  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 574 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 573 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 570 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 564 aa  529  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 566 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 578 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 574 aa  527  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 574 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 574 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 580 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 573 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 573 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 566 aa  518  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 577 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 566 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 582 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 578 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 570 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 578 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 566 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 567 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 569 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 567 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 580 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 569 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 571 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 571 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3670  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 581 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.981514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 571 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 568 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 568 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 580 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 578 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 574 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 571 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>