More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1242 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 582 aa  1192    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 574 aa  670    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 577 aa  689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 564 aa  661    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 577 aa  699    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 569 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 566 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 574 aa  578  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 575 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 585 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 566 aa  571  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 572 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 578 aa  564  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 564 aa  555  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 		 572 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 572 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10860  prolyl-tRNA synthetase, family II  50 
 
 		 588 aa  553  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 568 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 570 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 576 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 570 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 570 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 570 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 580 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 576 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 570 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 571 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 570 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 566 aa  531  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 574 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 573 aa  528  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 579 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 574 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 567 aa  527  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 569 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 569 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 569 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 574 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 574 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 575 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  46 
 
 		 570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 578 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 572 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 573 aa  515  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 584 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 578 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 576 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 571 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 578 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 573 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 571 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 578 aa  509  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 573 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 571 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 572 aa  510  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 565 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 571 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>