More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0748 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
572 aa  1160    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
570 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
572 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
574 aa  554  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
569 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
568 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
567 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
577 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
567 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
572 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
566 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
566 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
566 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
566 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
566 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
566 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
566 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
566 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
577 aa  535  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
566 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
566 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
567 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
566 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
567 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
567 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
573 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
573 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
564 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
572 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
582 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
585 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
570 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
570 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
572 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
564 aa  498  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
574 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  46.43 
 
 
570 aa  496  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
570 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
575 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
569 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
569 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
576 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
570 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
570 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
578 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
576 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
578 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
573 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
577 aa  490  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
578 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
578 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
571 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
574 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
578 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
573 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
575 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
571 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
579 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
578 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
571 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
571 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
578 aa  482  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
569 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
580 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
580 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
571 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
578 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
578 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  46 
 
 
573 aa  481  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
570 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
571 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
578 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
570 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
570 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
565 aa  481  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
569 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
577 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
572 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
574 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
574 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
571 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
582 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
572 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
570 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
571 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
571 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>