More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0745 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 572 aa  658    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 572 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 578 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 566 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  71.21 
 
 		 574 aa  809    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 571 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 572 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 		 578 aa  786    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 583 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3670  prolyl-tRNA synthetase  84.85 
 
 		 581 aa  1049    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.981514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  70.34 
 
 		 574 aa  812    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  76.86 
 
 		 581 aa  949    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 571 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  72.71 
 
 		 582 aa  867    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 571 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 570 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 571 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 572 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 571 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 578 aa  780    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 572 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 571 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 576 aa  690    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 571 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  65.91 
 
 		 580 aa  773    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  71.85 
 
 		 573 aa  848    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0745  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 581 aa  1193    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 579 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 572 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 571 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 578 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0775  prolyl-tRNA synthetase  83.79 
 
 		 581 aa  1023    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 571 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  66.49 
 
 		 578 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  67.2 
 
 		 578 aa  783    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 580 aa  761    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 571 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 578 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 572 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 569 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 571 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 572 aa  658    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 569 aa  688    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0846  prolyl-tRNA synthetase  83.79 
 
 		 581 aa  1023    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.889779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5481  prolyl-tRNA synthetase  80.9 
 
 		 581 aa  964    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  67.78 
 
 		 578 aa  787    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  54.96 
 
 		 572 aa  658    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 572 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  83.59 
 
 		 580 aa  1029    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 571 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 573 aa  737    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0833  prolyl-tRNA synthetase  88.3 
 
 		 580 aa  1072    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.508251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 578 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 571 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 578 aa  781    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 573 aa  651    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 569 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 		 572 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  72.76 
 
 		 573 aa  850    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 571 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 572 aa  658    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 578 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 578 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 571 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 571 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  67.55 
 
 		 578 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  70.86 
 
 		 574 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 571 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 570 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 570 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 572 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 574 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 571 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2392  prolyl-tRNA synthetase  79 
 
 		 581 aa  978    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 		 578 aa  782    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 571 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 571 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4212  prolyl-tRNA synthetase  83.79 
 
 		 581 aa  995    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 572 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 572 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 572 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  73.75 
 
 		 581 aa  909    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  67.55 
 
 		 578 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  67.13 
 
 		 578 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 572 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 570 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0527  prolyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 567 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.714642  normal  0.28807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 571 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03186  prolyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 564 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 564 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 572 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  68.09 
 
 		 578 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 571 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 578 aa  781    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 577 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1727  prolyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 564 aa  649    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>