More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0772 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 585 aa  748    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  71.18 
 
 		 580 aa  824    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 594 aa  670    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 608 aa  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  76.33 
 
 		 581 aa  905    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  65.21 
 
 		 597 aa  701    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  82.96 
 
 		 582 aa  986    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  61.25 
 
 		 596 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 582 aa  1165    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  63.73 
 
 		 591 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 586 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 584 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  69.16 
 
 		 588 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 		 582 aa  766    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 599 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 		 584 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 		 586 aa  753    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 582 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  72.04 
 
 		 580 aa  841    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  71.33 
 
 		 576 aa  816    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 584 aa  783    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  79.25 
 
 		 586 aa  942    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  71.48 
 
 		 585 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 603 aa  698    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 607 aa  651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  66.32 
 
 		 583 aa  769    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 594 aa  704    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  67.64 
 
 		 582 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 589 aa  736    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 584 aa  783    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 		 585 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  55.06 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 604 aa  615  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 569 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 570 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 573 aa  445  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 574 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 579 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 567 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 569 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 570 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 573 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 578 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 578 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 570 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 569 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 578 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 587 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 570 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 580 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  41.58 
 
 		 572 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 572 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 572 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 572 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0748  prolyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 572 aa  428  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>