More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1505 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 582 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  72.4 
 
 		 585 aa  846    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 584 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  73.2 
 
 		 594 aa  869    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 582 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  68.86 
 
 		 608 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  76.78 
 
 		 586 aa  875    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  65.21 
 
 		 582 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 581 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 599 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  67 
 
 		 594 aa  778    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 584 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 588 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  76.32 
 
 		 582 aa  875    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 		 582 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  64.88 
 
 		 604 aa  731    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 580 aa  722    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 597 aa  1174    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 584 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 		 586 aa  736    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  67.69 
 
 		 596 aa  783    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  61.72 
 
 		 610 aa  750    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  81.91 
 
 		 607 aa  881    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 603 aa  845    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  83.53 
 
 		 591 aa  918    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  74.62 
 
 		 586 aa  873    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 576 aa  730    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 583 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 585 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 		 589 aa  809    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  63.16 
 
 		 580 aa  708    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 584 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 585 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 572 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 578 aa  456  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 571 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 578 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 580 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  43.05 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 570 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 568 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 571 aa  439  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 570 aa  439  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 579 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 574 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0527  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 567 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.714642  normal  0.28807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>