More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1419 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 596 aa  724    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 584 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  59.77 
 
 		 580 aa  668    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 586 aa  763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 594 aa  765    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 576 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 582 aa  827    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 586 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 594 aa  731    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 582 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 		 586 aa  850    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  71.81 
 
 		 591 aa  799    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  61.67 
 
 		 580 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  60.83 
 
 		 582 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  71.26 
 
 		 607 aa  774    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 597 aa  808    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  67.67 
 
 		 585 aa  788    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  58.29 
 
 		 610 aa  689    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 584 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  61.77 
 
 		 582 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 585 aa  698    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 582 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 604 aa  671    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 588 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  88.31 
 
 		 603 aa  1078    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 599 aa  1199    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 583 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 608 aa  835    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 589 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  62.21 
 
 		 581 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 584 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 585 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 584 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 572 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 567 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 574 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 579 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 576 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 584 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 574 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 580 aa  415  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 566 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 569 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  40.33 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 577 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>