More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3197 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  71.94 
 
 		 586 aa  849    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  67.41 
 
 		 586 aa  752    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 585 aa  824    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 580 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 599 aa  781    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 		 594 aa  733    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 584 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 582 aa  736    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 584 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  64.04 
 
 		 608 aa  722    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  63.61 
 
 		 585 aa  708    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  71.94 
 
 		 582 aa  833    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 594 aa  732    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  63.34 
 
 		 580 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 588 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 582 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  57.07 
 
 		 610 aa  674    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 582 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 		 597 aa  784    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 576 aa  745    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 584 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 		 581 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 586 aa  747    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 		 596 aa  788    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  64.53 
 
 		 585 aa  723    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  69.14 
 
 		 591 aa  758    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 603 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  70.83 
 
 		 607 aa  746    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 604 aa  652    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 		 583 aa  670    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 582 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 589 aa  1185    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 584 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 576 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 570 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 574 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 570 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 567 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  44.56 
 
 		 570 aa  445  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 580 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 576 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 573 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 567 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 578 aa  432  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 566 aa  429  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 574 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 564 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 598 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 598 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 576 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>