More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1063 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
587 aa  1214    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
575 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 
574 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 
574 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3947  prolyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
575 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
570 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
572 aa  537  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
572 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
569 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
573 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
573 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
576 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
576 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
585 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
570 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
574 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
572 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1758  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.95234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3785  prolyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
565 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
570 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
573 aa  515  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
580 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
574 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
566 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
575 aa  505  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
570 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
570 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
567 aa  505  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
567 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
570 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
576 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
574 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
568 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
577 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
566 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
575 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
578 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
577 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
579 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
566 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
578 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
566 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
578 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
571 aa  484  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
566 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
578 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
578 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
578 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
578 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
578 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
584 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
578 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
564 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
569 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
570 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
570 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
564 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
573 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
569 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
568 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
574 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
574 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
578 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
578 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
573 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
573 aa  462  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
569 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
570 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
579 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  42.37 
 
 
570 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
574 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
600 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
573 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
600 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
573 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07441  prolyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
599 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
574 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
589 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
577 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>