More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1407 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  71.71 
 
 		 608 aa  852    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 596 aa  722    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  71.59 
 
 		 591 aa  817    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  70.21 
 
 		 607 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  57.52 
 
 		 610 aa  684    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 604 aa  678    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 582 aa  698    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 586 aa  854    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 582 aa  666    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 576 aa  688    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  66.39 
 
 		 586 aa  763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 582 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 597 aa  823    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 585 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 581 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 582 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 585 aa  778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  59.57 
 
 		 580 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 584 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  88.31 
 
 		 599 aa  1078    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  66 
 
 		 594 aa  781    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 586 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 588 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 594 aa  740    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  69.05 
 
 		 582 aa  826    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 603 aa  1202    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 584 aa  680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 583 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 589 aa  785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 584 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 585 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 580 aa  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 584 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 571 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 567 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 570 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 570 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 567 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  41.56 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 572 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 574 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 568 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 580 aa  415  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 577 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 574 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 573 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>