More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1519 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 
584 aa  743    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
599 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 
594 aa  652    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
596 aa  654    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
582 aa  756    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
585 aa  729    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  66.32 
 
 
582 aa  769    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 
586 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  66.84 
 
 
580 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 
586 aa  785    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 
582 aa  690    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 
585 aa  728    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 
580 aa  780    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 
586 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 
581 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 
582 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 
584 aa  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
584 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 
576 aa  729    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 
588 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
603 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 
597 aa  655    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  65.49 
 
 
582 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
583 aa  1162    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 
589 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 
584 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 
585 aa  725    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 
608 aa  633  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  61.34 
 
 
591 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  61.39 
 
 
607 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  52.33 
 
 
610 aa  597  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
604 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
570 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
572 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
572 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
569 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
564 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
574 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
579 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
573 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
571 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
570 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
570 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
580 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
574 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
567 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
567 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
567 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
574 aa  428  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
578 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
575 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
585 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  43.89 
 
 
570 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
570 aa  429  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
570 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
564 aa  423  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
573 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
575 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
571 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
570 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
567 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
573 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
576 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
571 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
578 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
566 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
566 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
576 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
576 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
574 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
565 aa  415  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4057  prolyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
574 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.391162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
566 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
570 aa  414  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
572 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
578 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
571 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4090  prolyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
574 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
571 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
572 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
566 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
578 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
571 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
578 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
574 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
578 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
577 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>