More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2200 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 		 596 aa  819    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  72.4 
 
 		 597 aa  822    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  75.26 
 
 		 607 aa  813    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  66.9 
 
 		 582 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1176    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  67.85 
 
 		 588 aa  752    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 580 aa  741    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  75.94 
 
 		 582 aa  884    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  72.09 
 
 		 591 aa  788    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 604 aa  692    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 582 aa  748    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 586 aa  783    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  70.65 
 
 		 581 aa  812    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  70.66 
 
 		 586 aa  806    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 594 aa  763    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 582 aa  738    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 584 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  66.04 
 
 		 585 aa  745    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  73.21 
 
 		 586 aa  876    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  67.46 
 
 		 582 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  65.73 
 
 		 608 aa  745    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  58.74 
 
 		 610 aa  702    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 		 576 aa  776    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 584 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  65.08 
 
 		 580 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  67.67 
 
 		 599 aa  788    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 584 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 594 aa  758    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 603 aa  778    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  67.19 
 
 		 585 aa  752    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 583 aa  729    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 589 aa  824    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 584 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 570 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 587 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 570 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 567 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 569 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  43.22 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 569 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 566 aa  432  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 570 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 584 aa  425  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 578 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 570 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 576 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 572 aa  422  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>