More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2147 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  63.92 
 
 		 591 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 		 582 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  56.04 
 
 		 610 aa  638    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 		 584 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  75.51 
 
 		 588 aa  870    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  75.52 
 
 		 585 aa  873    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 596 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 594 aa  698    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  71.33 
 
 		 582 aa  816    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  65.01 
 
 		 586 aa  742    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 597 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  72.15 
 
 		 582 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 599 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  67.07 
 
 		 580 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 		 585 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1149    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 594 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 		 607 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 582 aa  746    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  75.09 
 
 		 582 aa  858    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  78.56 
 
 		 585 aa  910    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 		 584 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 608 aa  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 580 aa  760    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  72.79 
 
 		 581 aa  839    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 586 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 586 aa  847    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 603 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 		 584 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 		 583 aa  729    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 589 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 		 584 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 604 aa  620  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 567 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 567 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  44.87 
 
 		 570 aa  441  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 587 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 566 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 574 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 569 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 574 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 574 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 598 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 566 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 570 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 598 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 576 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 580 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  41.75 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>