More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  69.75 
 
 		 582 aa  815    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 582 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 608 aa  723    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 604 aa  682    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 585 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 585 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 		 594 aa  751    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 599 aa  739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 576 aa  704    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 581 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 582 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 582 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 588 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  65.6 
 
 		 591 aa  735    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  70.47 
 
 		 586 aa  833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 586 aa  731    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  56.41 
 
 		 610 aa  692    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 584 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 584 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  67 
 
 		 597 aa  763    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 582 aa  673    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 580 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 584 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 596 aa  1189    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 594 aa  707    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  60.07 
 
 		 580 aa  690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 603 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 		 607 aa  731    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 585 aa  828    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 586 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 583 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 589 aa  799    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 		 584 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 574 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 566 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 576 aa  422  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 574 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 566 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 574 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 569 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 571 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 574 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 573 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 571 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 572 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 567 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 571 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 572 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 578 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 571 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 571 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 571 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 572 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002725  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0739643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>