More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1055 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  67.75 
 
 		 586 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 608 aa  661    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 584 aa  717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 		 594 aa  675    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  73.76 
 
 		 582 aa  859    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 607 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 597 aa  696    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  72.04 
 
 		 582 aa  841    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 594 aa  698    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 582 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 586 aa  730    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  62.52 
 
 		 591 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  82.9 
 
 		 580 aa  1003    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 576 aa  760    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 582 aa  770    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 		 585 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 585 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 582 aa  811    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 596 aa  678    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 584 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  59.77 
 
 		 599 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  63.49 
 
 		 586 aa  689    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  67.64 
 
 		 581 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 584 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 603 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 580 aa  1169    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 588 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 		 583 aa  780    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 589 aa  720    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 584 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 		 585 aa  732    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  55.09 
 
 		 610 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 604 aa  611  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 570 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 572 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 572 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 578 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 570 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 570 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 564 aa  444  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 574 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 574 aa  445  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 570 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 579 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 564 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 576 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 574 aa  435  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 587 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 571 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 573 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 569 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 574 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 567 aa  422  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  42.39 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 569 aa  425  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  422  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 576 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 572 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>