More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3553 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 584 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 582 aa  661    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 		 582 aa  718    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 588 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 597 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 586 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 585 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 584 aa  1168    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 580 aa  717    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 586 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 586 aa  715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  61.03 
 
 		 580 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 		 576 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 584 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 582 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 582 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 		 582 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 585 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 581 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 583 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 589 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 584 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 585 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  59.83 
 
 		 591 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 607 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 594 aa  621  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 594 aa  578  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  49.92 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 604 aa  558  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 570 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 570 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 566 aa  399  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 572 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 572 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 598 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 572 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3553  prolyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 598 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1529  prolyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  39.39 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 571 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 576 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 570 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 564 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 572 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 573 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 573 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 574 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 570 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 576 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 567 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 576 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1354  prolyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 613 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 569 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>