More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0982 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
570 aa  1167    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
572 aa  682    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
567 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
577 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
566 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
567 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
566 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
566 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
566 aa  598  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
567 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0247  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
620 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1913  prolyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
617 aa  570  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2432  prolyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
616 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
567 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
567 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
565 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
570 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
573 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
570 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
571 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
572 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
570 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
571 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
572 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
571 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
569 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
571 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
572 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
571 aa  519  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
571 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
571 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
571 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
571 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
569 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
572 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
569 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
571 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
572 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
572 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
572 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  44.29 
 
 
572 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
574 aa  512  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
571 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
578 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
572 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
572 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
572 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
570 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
570 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
568 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
578 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
572 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
571 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
572 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
578 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
572 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
566 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
571 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
572 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
578 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
572 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
578 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
572 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
571 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
572 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
574 aa  508  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
578 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
572 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
573 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
572 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
571 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
572 aa  505  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
571 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
584 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
574 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
571 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
574 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
578 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>