More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0247 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1913  prolyl-tRNA synthetase  86.18 
 
 		 617 aa  1118    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2432  prolyl-tRNA synthetase  67.53 
 
 		 616 aa  877    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0247  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 620 aa  1270    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 567 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 572 aa  621  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 566 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 566 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 566 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 566 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 577 aa  592  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 567 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 570 aa  579  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 568 aa  551  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 565 aa  538  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 569 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 571 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 585 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 574 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 570 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 573 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 573 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 580 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 578 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 578 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 578 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 578 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 571 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 580 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 578 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 580 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 575 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 570 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 578 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 578 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 574 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 578 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 575 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 579 aa  475  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 572 aa  475  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 572 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 573 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 570 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 570 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 576 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 571 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 571 aa  465  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>