More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2432 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 566 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 566 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1913  prolyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 617 aa  885    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 566 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 566 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 566 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 566 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 566 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 566 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 566 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 567 aa  645    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2432  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 616 aa  1248    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0247  prolyl-tRNA synthetase  67.53 
 
 		 620 aa  887    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 566 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 567 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 567 aa  586  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 570 aa  579  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 565 aa  557  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 569 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 568 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 570 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 576 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 574 aa  508  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 585 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 571 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 571 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 571 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 570 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 571 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 571 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 570 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 570 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 571 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 571 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 566 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 570 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 564 aa  488  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 574 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 570 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 574 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 571 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 575 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 572 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 571 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 564 aa  485  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 569 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 569 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 573 aa  485  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 577 aa  485  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 574 aa  485  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 576 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 571 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 571 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 574 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 569 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 574 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 578 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>