More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06960 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 607 aa  713    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 576 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  63.83 
 
 		 594 aa  724    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  55.77 
 
 		 610 aa  657    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 599 aa  842    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 582 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 582 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 596 aa  718    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  65.62 
 
 		 585 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 608 aa  1197    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 586 aa  798    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 604 aa  647    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 		 586 aa  676    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 588 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  64.84 
 
 		 586 aa  698    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 584 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 584 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 582 aa  808    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  68.86 
 
 		 597 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 585 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 580 aa  668    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 582 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  60.2 
 
 		 580 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  71.71 
 
 		 603 aa  860    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 582 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 583 aa  638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 594 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 581 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 589 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 584 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 585 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  67.44 
 
 		 591 aa  727    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 584 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 573 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 571 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 571 aa  429  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0892  prolyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 574 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 566 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1758  prolyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 562 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.95234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  40.98 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 572 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 566 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 580 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 570 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 572 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 572 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002725  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 571 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0739643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 571 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 572 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 572 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>