More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2308 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 582 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 582 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 608 aa  657    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 586 aa  721    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 599 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  75.52 
 
 		 576 aa  873    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 597 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 		 582 aa  785    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  63.78 
 
 		 596 aa  690    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  66.44 
 
 		 580 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 594 aa  666    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  84.98 
 
 		 584 aa  994    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  62.76 
 
 		 591 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 		 580 aa  732    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  66.04 
 
 		 585 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  67.64 
 
 		 582 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 594 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  84.98 
 
 		 584 aa  994    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 584 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 		 586 aa  665    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  76.39 
 
 		 585 aa  875    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  88.83 
 
 		 588 aa  1023    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 603 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 607 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 583 aa  725    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  82.94 
 
 		 582 aa  940    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 581 aa  826    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  63.61 
 
 		 589 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  71.79 
 
 		 586 aa  830    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  84.98 
 
 		 584 aa  994    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1174    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  56.22 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 604 aa  608  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 579 aa  432  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 570 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 570 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 574 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 580 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 574 aa  419  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 569 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 573 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 574 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 566 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 568 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0714  prolyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 572 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  41.84 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 573 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1063  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408216  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 580 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 576 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 571 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0478  prolyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.450572  normal  0.306292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 571 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 569 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2560  prolyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.699374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>