More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5847 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  62.21 
 
 		 599 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 597 aa  721    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64.81 
 
 		 607 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  81.27 
 
 		 586 aa  974    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  75.6 
 
 		 582 aa  882    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 586 aa  675    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  76.33 
 
 		 582 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 594 aa  680    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  70.65 
 
 		 585 aa  812    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 586 aa  769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 596 aa  708    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  66.55 
 
 		 580 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 584 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  64.33 
 
 		 591 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 		 588 aa  820    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  72.43 
 
 		 584 aa  835    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  55.59 
 
 		 610 aa  641    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  72.61 
 
 		 582 aa  803    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 594 aa  707    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  72.43 
 
 		 584 aa  835    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  74.52 
 
 		 585 aa  876    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  67.64 
 
 		 580 aa  769    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  72.79 
 
 		 576 aa  839    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 581 aa  1165    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 582 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 582 aa  776    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 603 aa  710    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 583 aa  759    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 608 aa  671    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 		 589 aa  759    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  72.43 
 
 		 584 aa  835    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 585 aa  826    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 604 aa  629  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 574 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 572 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 578 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  42.83 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 569 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 572 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 572 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 571 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 569 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 571 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 571 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 569 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 572 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 569 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 570 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 569 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 572 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 571 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 567 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>