More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1055  prolyl-tRNA synthetase  67.75 
 
 		 580 aa  778    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0165887  normal  0.0425214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4045  prolyl-tRNA synthetase  73.12 
 
 		 588 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5847  prolyl-tRNA synthetase  81.27 
 
 		 581 aa  974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0165369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0772  prolyl-tRNA synthetase  79.25 
 
 		 582 aa  942    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.594959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1015  prolyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 594 aa  720    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06960  prolyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 		 608 aa  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3553  prolyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 584 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279116  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23500  prolyl-tRNA synthetase, family II  64.92 
 
 		 591 aa  691    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.759854  normal  0.0415508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1505  prolyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 		 597 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1436  prolyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 		 586 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3598  prolyl-tRNA synthetase  75.43 
 
 		 582 aa  868    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1206  prolyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 607 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0467649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2107  Proline--tRNA ligase  68.51 
 
 		 580 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205273  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10160  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 586 aa  1172    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4009  prolyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 582 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2076  prolyl-tRNA synthetase  71.58 
 
 		 584 aa  830    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7754  prolyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 		 582 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0890293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2200  prolyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 585 aa  783    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000481191  decreased coverage  0.000820909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1707  prolyl-tRNA synthetase  74.56 
 
 		 585 aa  857    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0818923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10270  prolyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 594 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11400  prolyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 596 aa  705    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000935816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2147  prolyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 576 aa  847    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1419  prolyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 599 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2494  prolyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 		 586 aa  696    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1407  prolyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 603 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2059  prolyl-tRNA synthetase  71.58 
 
 		 584 aa  830    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0727761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1519  prolyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 		 583 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0864043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12860  prolyl-tRNA synthetase  71.2 
 
 		 582 aa  792    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3197  prolyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 589 aa  747    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0619868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2122  prolyl-tRNA synthetase  71.58 
 
 		 584 aa  830    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562732  normal  0.015266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2308  prolyl-tRNA synthetase  71.79 
 
 		 585 aa  830    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0228399  normal  0.099086 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1079  proline--tRNA ligase  54.21 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1906  prolyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 604 aa  622  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 574 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 572 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 569 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002725  prolyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0739643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 574 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 580 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 567 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 578 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 578 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 571 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 574 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 578 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 574 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 578 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 569 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 576 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 573 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>